Wśród uczennic Akademii Shinyo krążą ciche plotki o tajemniczym bycie nadprzyrodzonym — Boogiepopie. Uważany przez wielu za Shinigami, który zabija ludzi u szczytu ich piękna, nim ich urok przeminie, w rzeczywistości ukrywa o wiele bardziej złożoną tożsamość. Boogiepop to opiekun, który odradza się jako alter ego licealistki Touki Miyashity, by stawić czoła „wrogom świata”. Gdy w szkole zaczynają znikać uczniowie, uznawani za zwykłych uciekinierów, Boogiepop budzi się ponownie, by rozwiązać tajemnicę. Jednak gdzieś na terenie akademii czai się niebezpieczne stworzenie, czekające na idealny moment do ataku.
Akcja serii rozgrywa się w mrocznej rzeczywistości, gdzie granica między codziennością a nadprzyrodzonym jest wyjątkowo krucha. Boogiepop wa Warawanai w subtelny sposób eksploruje złożone relacje, wspomnienia i emocje bohaterów, jednocześnie stawiając pytania o ludzką naturę i postrzeganie czasu. To intrygujące, pełne tajemnic anime utrzymane jest w melancholijnym, niepokojącym tonie.
