Bukiyou na Senpai opowiada historię niezdarnej i nieśmiałej Kannawy, która w szkole znana jest ze swojej nieporadności. Choć jest lubiana, nikt nie uważa jej za osobę pewną siebie czy przebojową. Jej codzienne życie nagle zmienia się, gdy poznaje swojego nowego młodszego kolegę – Kamegawę. Chłopak jest uroczym, lekko nerdowatym pierwszakiem, z którym Kannawa zaskakująco łatwo nawiązuje rozmowę. To nietypowe spotkanie staje się początkiem pełnej nieporozumień i zabawnych sytuacji relacji, w której Kannawa musi zmierzyć się z rodzącymi się uczuciami i własną nieporadnością.

Bukiyou na Senpai to ciepła, lekko humorystyczna opowieść o szkolnych relacjach, pierwszych zauroczeniach i przezwyciężaniu własnych barier. W centrum fabuły znajduje się relacja bohaterki z jej nowym kouhai, a na tle codziennego szkolnego życia rozgrywa się opowieść o dojrzewaniu, akceptacji i odkrywaniu siebie.