Pewnego dnia młody chłopiec imieniem Yosuke odkrywa tajemnicze stworzenie o imieniu Coo, pochodzące z odległych mórz przeszłości. Okazuje się, że jest ono prehistorycznym dinozaurem, który przetrwał do współczesnych czasów, ukryty w głębiach oceanu. Między Yosuke a stworzeniem szybko rodzi się niezwykła i wzruszająca przyjaźń. Chłopiec postanawia pomóc swemu nowemu towarzyszowi odnaleźć swoje miejsce w dzisiejszym świecie, co jednak szybko okazuje się niełatwym zadaniem. Konflikt pojawia się, gdy istnienie Coo staje się medialną sensacją, a ludzie próbują wykorzystać stworzenie dla własnych korzyści. Ton filmu jest ciepły i nostalgiczny, z naciskiem na harmonię z przyrodą oraz próbą znalezienia porozumienia między światem ludzi a naturą. Coo: Tooi Umi kara Kita Coo to przygodowa historia o przyjaźni, tolerancji, szacunku do natury i akceptacji odmiennego pochodzenia.
