W 2016 roku katastrofa nuklearna zamieniła Tokio w radioaktywne, opuszczone pustkowie. Tworząc specjalne genetycznie modyfikowane istoty—znane jako Coppelion—odporne na zabójcze promieniowanie, rząd japoński wysyła je do skażonej stolicy w celu zbadania sytuacji i odnalezienia ocalałych. Historia toczy się wokół trzech nastolatek: Ibara Naruse, Aoi Fukasaku i Taeko Nomury, które wkraczają do ruin Tokio, mierząc się z pustką i niebezpieczeństwami porzuconego miasta. Coppelion ukazuje trudne dylematy moralne, z jakimi spotykają się bohaterki, próbując spełniać swoją misję ratunkową w świecie pełnym niepewności, konfliktów i sekretów. Seria utrzymana jest w posępnym, postapokaliptycznym klimacie, równoważąc dramat, akcję i elementy sci-fi.
