Dziewięcioro ludzi z różnych zakątków świata zostaje porwanych przez tajemniczą organizację Black Ghost i przemienionych w zaawansowane cyborgi bojowe. Nazywani przez swoich porywaczy numerami od 001 do 009, zyskują niezwykłe zdolności, mające posłużyć jako potężna broń w realizacji globalnych ambicji organizacji. Jednak dziewiąty cyborg, Joe Shimamura (009), nie chce utracić swego człowieczeństwa i buntuje się przeciwko swoim stwórcom. Wraz ze swoimi współtowarzyszami decydują się stanąć do walki, by odzyskać wolność, odnaleźć własną tożsamość oraz powstrzymać mroczne plany Black Ghost. Seria łączy dramatyczne wątki science-fiction i napiętą akcję z refleksją nad istotą człowieczeństwa oraz granicami technologicznego postępu.