W mrocznej przyszłości, po globalnej katastrofie znanej jako Twin X, Ziemia pokryta jest ponurym niebem, a technologia stała się nieprzewidywalnym zagrożeniem. Historię śledzimy oczami dwójki rodzeństwa, Tatsuyi i Kiyoko, którzy przypadkowo zostają wplątani w konflikt między dwoma tajemniczymi frakcjami: Orga oraz Gilgamesh. Orga pragnie odbudować utraconą cywilizację, natomiast Gilgamesh podąża za swoimi ukrytymi celami, które mogą całkowicie zmienić przyszłość ludzkości. Główni bohaterowie stają przed pytaniem o to, komu można zaufać oraz jaką rolę powinni odegrać w postapokaliptycznym świecie. Pełna atmosferycznej grozy, filozoficznych refleksji oraz mrocznej stylistyki, seria Gilgamesh ukazuje napięcie między wiarą w technologię a strachem przed zagładą, zapraszając widza do głębokiej refleksji nad ludzką naturą i konsekwencjami niezrozumiałej nauki.
