Asaba Naoyuki jest zwyczajnym chłopakiem, który wiedzie spokojne życie w małym japońskim miasteczku. Wszystko zmienia się pewnego lata, kiedy w pobliżu dochodzi do tajemniczych incydentów związanych z pojawianiem się niezidentyfikowanych obiektów latających. Pewnej nocy Naoyuki spotyka enigmatyczną dziewczynę o imieniu Iriya Kana — cichą, zamkniętą w sobie, lecz ukrywającą niezwykłe sekrety. Stopniowo chłopak odkrywa, że Iriya jest uwikłana w tajne operacje wojskowe, a losy całego świata mogą zależeć właśnie od niej.
„Iriya no Sora, UFO no Natsu” to nostalgiczna historia łącząca elementy romansu, dramatu i science fiction. W tle narastającego napięcia i widma wojny rozwija się wzruszająca relacja dwojga bohaterów, starających się razem stawić czoła własnym lękom i nieuchronnym wyborom przyniesionym przez pełne tajemnic lato.
