„Kaze ga Tsuyoku Fuiteiru” to historia Kakeru Kurahary, byłego asa biegowego liceum Sendai Josei, który po incydencie ze sklepowym kradzieżą, wpada na Haiji Kiyose, drugiego studenta ze swojego uniwersytetu. Haiji, pod wrażeniem zręczności Kakeru, namawia go do zamieszkania w Chikusei-sou, zrujnowanym apartamencie, w którym mieszka razem z ośmioma innymi studentami. Kiedy Haiji ujawnia, że budynek jest domkiem akademickim Kansei University Track Club, prezentuje również swój cel – udział w Hakone Ekiden, jednym z najbardziej prestiżowych uniwersyteckich maratonów w Japonii. Czy pomimo braku doświadczenia i braku zainteresowania ze strony reszty mieszkańców, uda mu się przekonać ich do wzięcia udziału i zrealizować swój cel?