Jest rok 2040. Po tajemniczej katastrofie Tokio zostało zniszczone i odbudowane w wielkim trudzie jako ekologiczna metropolia. Jednak za pozornie spokojnym rozwojem kryją się intrygi i sekrety megakorporacji DC, których działania prowadzą do licznych anomalii środowiskowych. W tej napiętej atmosferze młody chłopak imieniem Ken Ando stara się odnaleźć prawdę po dołączeniu do organizacji zajmującej się przeciwdziałaniem kryzysom ekologicznym. Kiedy nagle pojawia się tajemniczy humanoidalny mech zwany Cybusterem, kierowany przez enigmatycznego pilota imieniem Masaki, życie Kena wywraca się do góry nogami. Obaj bohaterowie zostają wciągnięci w wir konfliktu, który zaważy na losach świata. „Masou Kishin Cybuster” to klasyczna mecha anime, historie pełne epickich walk i napięcia, pokazujące jak determinacja, przyjaźń oraz pragnienie poznania prawdy stają się bronią w starciu z bezwzględnością potężnych korporacji.
