Argento Soma to emocjonalna opowieść rozgrywająca się w niedalekiej przyszłości, kiedy Ziemię nawiedzają tajemnicze, metaliczne istoty. Główny bohater, student metalurgii Takuto Kaneshiro, bierze udział w eksperymencie mającym na celu ożywienie stworzenia określanego mianem Frank, stworzonego z fragmentów pokonanych obcych. Gdy projekt zostaje niespodziewanie zaatakowany, tragedia niszczy życie Takuto, pozostawiając go z bliznami psychicznymi i fizycznymi oraz ogromnym pragnieniem zemsty. Po spotkaniu z enigmatycznym człowiekiem przedstawiającym się jako „Pan X”, Takuto wciela się w postać pilota wojskowego imieniem Ryu Soma, dołączając do organizacji wojskowej FUNERAL, która walczy ze wspomnianymi najeźdźcami. Jego dążenie do zemsty ściera się z lojalnością wobec towarzyszy oraz koniecznością ochrony planety. W tle rozwija się zagadkowa relacja między dziewczynką Harriet – zdolną do komunikacji z istotą Frank – a przeszłością i wspomnieniami Ryu. Argento Soma utrzymane jest w poważnym, dramatycznym tonie, eksplorując tematy tożsamości, straty i przebaczenia.

