Neo Domino Miasto to futurystyczna metropolia, gdzie pojedynki karciane nazywane Duelem potoczyły się o krok dalej – teraz odbywają się na motocyklach zwanych Duel Runnerami. Młody chłopak Yusei Fudo, utalentowany jeździec, mieszka na obrzeżach miasta w biednej dzielnicy Satellite, odizolowanej od reszty społeczeństwa przez niesprawiedliwy system społeczny. Jego celem jest odzyskanie utraconego honoru oraz odkrycie tajemnicy znaków w kształcie smoka, które pojawiają się na nim i czwórce innych duelistów.
Wciągnięty w starodawną legendę Pięciu Smoków i konfrontację ze złowrogimi siłami, Yusei i jego towarzysze muszą zmierzyć się z licznymi przeciwnikami, jednocześnie rozgrywając spektakularne pojedynki na Duel Runnerach. „Yu☆Gi☆Oh! 5D’s” jest widowiskowym połączeniem dynamicznych starć, przyjaźni i rywalizacji, toczących się w cyberpunkowej, pełnej akcji i intryg scenerii.
