W futurystycznym świecie planety Zi, Zoids—potężne maszyny bojowe przypominające zwierzęta—stanowią podstawę rywalizacji, walk i sportowych turniejów. R.D. jest młodym, pełnym energii pilotem Zoida o imieniu Liger Zero, pragnącym zbudować swoją reputację w Bitwach Zoidów, arenie zaciętych zmagań pilotów. Kiedy odkrywa tajemnicę zjawiska „fuzji”, pozwalającej dwóm Zoidom łączyć się w potężniejszą formę bojową, R.D. rozpoczyna podróż w poszukiwaniu partnerów, by zdobyć sławę i odkryć swoje prawdziwe przeznaczenie. Jednak konkurencja staje się coraz trudniejsza, a mroczne siły mają wobec fuzji własne plany. Zoids Fuzors to emocjonująca seria łącząca elementy akcji oraz przygody, koncentrująca się na przyjaźni, rywalizacji i ryzykującym wszystko, ambitnym młodzieńcu, pragnącym zapisać się na kartach historii Zoidów.