Rin to siedemnastoletnia dziewczyna, która żyje zupełnie sama w futurystycznym świecie będącym jedynie wirtualną symulacją. Każdego dnia kreuje wokół siebie przepiękne krajobrazy, kontrolując scenerię i dostosowując ją do swojej wyobraźni za pomocą tabletu. Jednakże za idylliczną scenerią kryje się tajemnica, której Rin nie potrafi sobie przypomnieć—wspomnienia o swojej przeszłości, rodzinie i tym, jak znalazła się w tym niezwykłym miejscu. Pewnego dnia odkrywa wskazówki prowadzące do odblokowania prawdy skrywanej za tą wyizolowaną egzystencją. „Shelter” to poruszająca, refleksyjna animacja krótkometrażowa ukazująca uczucia samotności, tęsknoty oraz siłę pamięci, co nadaje produkcji sentymentalny, emocjonalny charakter.
