„86” to anime, które zabiera nas do świata, gdzie trwa wojna między Republiką San Magnolia a Imperium Giadian. Według oficjalnej propagandy, konflikt toczy się bez ofiar, jednak rzeczywistość jest zupełnie inna. Tych, którzy wyglądają inaczej, przymusowo przydziela się do tajnej, osiemdziesiątej szóstej frakcji, zmuszając do walki z autonomią Legionu Imperium. Korzystają z nich tak zwani „Handlers” z Republiki.
Vladilena Milizé zostaje przypisana do oddziału „Spearhead”, zastępując ich poprzedniego Handlersa. Mimo że spotyka na swojej drodze wiele przeciwności, nadal walczy przeciwko niesprawiedliwości. Shinei Nouzen, kapitan oddziału Spearhead, jest znanym ocalałym z każdego oddziału, w którym był. Na jego barkach spoczywają imiona i pragnienia poległych towarzyszy. Gdy losy tych młodych dusz z dwóch różnych światów się przecinają, czy zapoczątkują iskrę, która oświetli ich drogę do zbawienia, czy spłoną w płomieniach rozpaczy?