„Project A-Ko 2: Daitokuji Zaibatsu no Inbou” to kontynuacja ekscytujących przygód A-Ko i jej przyjaciół. Trzy tygodnie po incydencie, który skończył się balansowaniem statku kapitana Napolipolity na szczycie Graviton City, nasza bohaterka i jej drużyna wyjeżdżają na letnie wakacje. Podczas gdy A-Ko zastanawia się nad zrzuceniem kilku kilogramów, a B-Ko planuje kolejne strategie na pokonanie swojej rywalki i zdobycie serca C-Ko, Napolipolita i Spy-D przemęczeni tęsknotą za ojczystą planetą, desperacko szukają sposobu na powrót. Tymczasem, Hikari Daitokuji – ojciec B-Ko i prezes Daitokuji Financial Group – zbroi lokalną armię nowymi mechas, by zaatakować statek Napolipolity i zdobyć jego zaawansowaną technologię.