„Ayakashi” to historia Yuu Kusaki, który w dzieciństwie złożył przysięgę, że będzie bronić słabych i stać po stronie sprawiedliwości. Po śmierci przyjaciela, jednak, traci pragnienie spełnienia tej przysięgi i zamiast pomagać innym, wykorzystuje swoją tajemniczą moc do zarabiania pieniędzy. Wszystko zmienia się, gdy musi bronić swojego życia przeciwko innemu uczniowi o podobnych mocach. Uratowana przez tajemniczą Eimu Yoake, która również posiada dziwne moce, Yuu dowiaduje się o Ayakashi – pasożytującej istocie, która nadaje swojemu gospodarzowi specjalne zdolności, ale stopniowo go osłabia. Teraz, świadomy swojego Ayakashi, Yuu musi wypełnić swoją przysięgę z dzieciństwa i stawić czoła tym, którzy używają swoich mocy do zła, jednocześnie rozwijając tajemnicę śmierci swojego przyjaciela.