„Blame! Movie” to film anime, w którym młoda dziewczyna o imieniu Zuru rozpoczyna ekspedycję w poszukiwaniu jedzenia przez postapokaliptyczne miasto kontrolowane przez maszyny. Sytuacja komplikuje się, gdy niechcący aktywują obronny program AI miasta, zwanego Safeguard. Kiedy maszyny atakują, nieoczekiwanie pojawia się tajemniczy mężczyzna, Killy, który eliminuje zagrożenie. Mimo to Zuru nie ufając Killy’emu, kwestionuje jego motywy. Ten z kolei odsłania, że poszukuje ludzi posiadających Geny Terminala Sieciowego – cechę, która pozwoliłaby ludzkości odzyskać kontrolę nad ich cywilizacją i wyłączyć Safeguard. Przekonana przez niego, Zuru i jej drużyna dołączają do Killy’ego w tej pełnej niebezpieczeństw misji.