„Chinmoku no Kantai” to intensywna opowieść o zimnowojennym świecie, gdzie podczas współpracy Japońskiej Morskiej Samoobrony z Marynarką Wojenną Stanów Zjednoczonych, tworzą wspólnie atomowy okręt podwodny. W trakcie jego pierwszego rejsu, kapitan ogłasza okręt niezależnym państwem o nazwie „Yamato”.