W świecie zdziesiątkowanym przez tajemniczy wirus większość dorosłych ginie, pozostawiając ziemię w ruinie. W obliczu tej katastrofy na powierzchnię wychodzą wampiry, obejmując kontrolę nad pozostałymi przy życiu dziećmi, zmuszając je do życia jako żywy magazyn krwi. Historia przedstawia losy Yuichiro Hyakuyi, chłopca, któremu udaje się uciec z krwawej niewoli. Składając przysięgę zemsty przeciwko brutalnym stworzeniom, dołącza do ludzkiego ruchu oporu, aby walczyć o wolność ocalałej ludzkości. Podczas gdy Yuichiro szkoli się, by stać się silnym wojownikiem, odkrywa, że za przetrwanie ludzkości i siły mroku odpowiedzialne są mroczne, niejednoznaczne tajemnice. „Owari no Seraph” utrzymane jest w ponurym, mrocznym klimacie, łącząc dramat postapokaliptyczny, fantasy i intensywne walki z subtelnym wątkiem przyjaźni i lojalności wobec bliskich osób.
