„Busou Chuugakusei: Basket Army” to historia, która rozgrywa się w sierpniu 2026 roku w Ośrodku Szkoleniowym Fuji. Główną bohaterką jest Natori Touko, uczennica trzeciej klasy prywatnej Akademii Obrony Wschodniej, która poddawana jest surowemu treningowi pod okiem nauczyciela Kamiya. Mimo trudności, jest to w końcu ostatni dzień. Kamiya proponuje dodatkowe zajęcia pod nazwą „Najnowsze Badania nad Bronią”. Ale wtedy zdarza się incydent, który wstrząsa całym Japonią.