Aoba Watase to zwykły uczeń liceum żyjący spokojnym dniem codziennym, aż do momentu gdy niespodziewany atak wciąga go w wir nieprzewidzianego konfliktu. W tajemniczych okolicznościach, zostaje nagle przeniesiony do przyszłości, w której ludzkość toczy zacięte wojny z użyciem zaawansowanych mechów zwanych „Valiancer”. Wplątany w międzyplanetarny konflikt, Aoba poznaje pilota Dio Weinberga; ich osobiste losy splatają się ze sobą, gdy odkrywają, że razem mogą aktywować zaawansowany mechanizm bojowy o nazwie Coupling System, pozwalający na potężną synchronizację zdolności bojowych pilotów. Młody chłopak stawia czoła nieznanym mu wyzwaniom, próbując zrozumieć przyczyny swojego przemieszczenia w czasie oraz rolę, jaką pełni w tej nowej rzeczywistości. Przesiąknięty dynamicznymi starciami, elementami sci-fi oraz tematyką przyjaźni i współpracy, „Buddy Complex” ukazuje emocjonującą walkę o przyszłość ludzkości.

